标签“ 癌症 ”下的所有文章

跟风做课题有风险，你研究的eRNA靠不靠谱？

• 作者: Xiaofei
• 时间: 2019-11-24
• 分类: 论文解读

增强子RNA（Enhancer RNA，eRNA）近期好像因为Nature Communications的一篇文章又火了一下，作者还甩出了一个叫eRic的数据库[1]，里面不仅整理好了TCGA各...

maftools使用方法总结以及常见问题

• 作者: Xiaofei
• 时间: 2019-06-07
• 分类: 技术分享

本文作为总结篇，将在这里对已经写过的几篇文章内容进行概括，可作为整个系列文章的目录，此外还有一些常见问题的解决方法。加上本篇目前一共写了5篇maftools相关文章，基本上按照整个官方文档使用T...

肿瘤变异数据分析和可视化工具maftools：CNV的可视化

• 作者: Xiaofei
• 时间: 2019-06-07
• 分类: 技术分享

Maftools系列文章：《maftools使用方法总结以及常见问题》《肿瘤变异数据分析和可视化工具maftools：安装和文件格式要求》《肿瘤变异数据分析和可视化工具maftools：突变数据...

肿瘤变异数据分析和可视化工具maftools：突变的数据分析

• 作者: Xiaofei
• 时间: 2019-06-07
• 分类: 技术分享

Maftools系列文章：《maftools使用方法总结以及常见问题》《肿瘤变异数据分析和可视化工具maftools：安装和文件格式要求》《肿瘤变异数据分析和可视化工具maftools：突变数据...

肿瘤变异数据分析和可视化工具maftools：突变数据下载和可视化

• 作者: Xiaofei
• 时间: 2019-06-07
• 分类: 技术分享

Maftools系列文章：《maftools使用方法总结以及常见问题》《肿瘤变异数据分析和可视化工具maftools：安装和文件格式要求》《肿瘤变异数据分析和可视化工具maftools：突变数据...

肿瘤变异数据分析和可视化工具maftools：安装和文件格式要求

• 作者: Xiaofei
• 时间: 2019-06-07
• 分类: 技术分享

Maftools系列文章：《maftools使用方法总结以及常见问题》《肿瘤变异数据分析和可视化工具maftools：安装和文件格式要求》《肿瘤变异数据分析和可视化工具maftools：突变数据...

VAF，MAF，肿瘤纯度，MCF，CCF的概念和计算方法

• 作者: Xiaofei
• 时间: 2019-06-06
• 分类: 技术分享

VAF的概念和计算方法VAF的全称是Variant Allele Frequency（变异等位基因频率）或Variant Allele Fraction（变异等位基因分数）。简单来说就是在基因组...

生物信息学预测肿瘤新抗原（新表位）：软件和阈值的选择

• 作者: Xiaofei
• 时间: 2019-05-25
• 分类: 论文解读

癌症疫苗靶向肿瘤细胞的抗原可以大致分为两类：肿瘤相关性抗原（tumor-associatied self-antigen）以及肿瘤特异性抗原（tumor-specific antigen）。前者...