Xiaofei文章列表

maftools使用方法总结以及常见问题

• 作者: Xiaofei
• 时间: 2019-06-07
• 分类: 技术分享

本文作为总结篇，将在这里对已经写过的几篇文章内容进行概括，可作为整个系列文章的目录，此外还有一些常见问题的解决方法。加上本篇目前一共写了5篇maftools相关文章，基本上按照整个官方文档使用T...

肿瘤变异数据分析和可视化工具maftools：CNV的可视化

• 作者: Xiaofei
• 时间: 2019-06-07
• 分类: 技术分享

Maftools系列文章：《maftools使用方法总结以及常见问题》《肿瘤变异数据分析和可视化工具maftools：安装和文件格式要求》《肿瘤变异数据分析和可视化工具maftools：突变数据...

肿瘤变异数据分析和可视化工具maftools：突变的数据分析

• 作者: Xiaofei
• 时间: 2019-06-07
• 分类: 技术分享

Maftools系列文章：《maftools使用方法总结以及常见问题》《肿瘤变异数据分析和可视化工具maftools：安装和文件格式要求》《肿瘤变异数据分析和可视化工具maftools：突变数据...

肿瘤变异数据分析和可视化工具maftools：突变数据下载和可视化

• 作者: Xiaofei
• 时间: 2019-06-07
• 分类: 技术分享

Maftools系列文章：《maftools使用方法总结以及常见问题》《肿瘤变异数据分析和可视化工具maftools：安装和文件格式要求》《肿瘤变异数据分析和可视化工具maftools：突变数据...

肿瘤变异数据分析和可视化工具maftools：安装和文件格式要求

• 作者: Xiaofei
• 时间: 2019-06-07
• 分类: 技术分享

Maftools系列文章：《maftools使用方法总结以及常见问题》《肿瘤变异数据分析和可视化工具maftools：安装和文件格式要求》《肿瘤变异数据分析和可视化工具maftools：突变数据...

VAF，MAF，肿瘤纯度，MCF，CCF的概念和计算方法

• 作者: Xiaofei
• 时间: 2019-06-06
• 分类: 技术分享

VAF的概念和计算方法VAF的全称是Variant Allele Frequency（变异等位基因频率）或Variant Allele Fraction（变异等位基因分数）。简单来说就是在基因组...

使用最小二乘法和梯度下降法进行线性回归分析

• 作者: Xiaofei
• 时间: 2019-06-01
• 分类: 技术分享

线性回归问题线性回归问题即已知一系列样本的自变量和因变量的值，求解以下方程中的各θj：$$h_θ(x) = θ_0 + θ_1x_1 + θ_2x_2 + \cdots + θ_nx_n$$设样...

生物信息学预测肿瘤新抗原（新表位）：软件和阈值的选择

• 作者: Xiaofei
• 时间: 2019-05-25
• 分类: 论文解读

癌症疫苗靶向肿瘤细胞的抗原可以大致分为两类：肿瘤相关性抗原（tumor-associatied self-antigen）以及肿瘤特异性抗原（tumor-specific antigen）。前者...

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